В 1984 окончил Одесскую консерваторию по классам фортепиано у профессора Людмилы Гинзбург и органа у доцента Валерия Рубахи. Совершенствовался на многих мастер-классах у ведущих органистов Западной Европы: Пита Кее, Харальда Фогеля, Ханса Фагиуса, Ги Бове, Людгера Ломанна, Йона Лауквика, Петера Планявски и многих других.

В 1986 изучал искусство органостроения у главного органного мастера Домского концертного зала в Риге Гунара Далманиса. В 1987 участвовал в монтаже челябинского органа “Hermann Eule”. С этого же года работает солистом-органистом и мастером-хранителем органа Челябинской филармонии.

С 1992 Владимир Хомяков является артистическим директором Челябинских международных органных фестивалей («Новое органное движение», «Прощай, XX век», «Laudatio Organi», «Джаз на большом органе», «Фестиваль премьер», и др.).

Ведёт активную концертную деятельность в стране и за рубежом. Выступал с концертами в большинстве органных залов СНГ, а также в Германии, Швейцарии, Голландии, Италии, Дании, Швеции и Финляндии.

Обладая обширным и разнообразным репертуаром, охватывающим органную музыку четырёх столетий, В. Хомяков часто включает в программы произведения современных авторов и новую импровизационную музыку.

В 2001 году Владимир Хомяков стал победителем первого международного конкурса "Jazz & Churchorgan" (Ганновер, Германия) и участвовал в совместном концертном туре по Германии с известными джазовыми органистами Западной Европы - Барбарой Деннерляйн, Родой Скотт и Яспером ван'т Хофом.

С большим интересом относится к новым формам концертов. Экспериментальные проекты: программы с ведущими музыкантами российской джазовой сцены - Даниилом Крамером (рояль), Аркадием Шилкопером (валторна), Сергеем Пронем (труба), Игорем Паращуком (саксофон), Алексеем Кругловым (саксофон), Игорем Захаровым и Олегом Юдановым (ударные), а также Даниэлем Шмалем (труба, Германия) и этно-оркестром под управлением Виталия Владимирова (Екатеринбург); организация органных фестивалей, целиком посвященных джазу во всем его стилистическом разнообразии "Jazz & Pipe Organ" (Челябинск 2004, 2005, 2008, 2015), а также первого в России фестиваля авангардной органной музыки "Organissimo!" (Челябинск 2010).